ノートパソコンを長時間使用する場合人体に与える影響が懸念されている。ノートパソコンの場合、ディスプレイが目線より下に存在することになり、常に首を曲げた状態で作業をする必要が生じる。これによって肩凝りや頭痛、長期的には深刻な疾病に至る事が懸念されている。これを防ぐためには一定時間ごとに休息し、マッサージをしたりする対症療法的な方法と、モバイル以外の環境では視線を落とすことなく視認可能な外部ディスプレイに接続するなどの方法を取ることが薦められている。

また、バッテリーの過熱・発火事故によりひざをやけどする被害も起きているため、電車の座席等でひざの上にノートパソコンを置く場合は十分注意するべきである。